ФК «Ужгород» було створено у 2015 році. Команда розпочала свій виступ з чемпіонату області і у перший сезон одразу ж стала йо¬го переможцем, а та¬кож володарем кубка Закарпаття. У наступному сезоні ФК «Ужгород» знову став чемпіоном та володарем кубка об¬ласті. У чемпіонаті області ужгородці на два пункти випередили «Севлюш» Виноградів і здолали цього ж супер¬ника у вирішальному кубковому матчі – 2:0. Наступного сезону ФК «Ужгород» став п’ятим у обласному чемпіонаті, а у 2018 році – здобув бронзові нагороди.
У сезоні 2018/19 років ФК «Ужгород» дебютував у чемпіонаті України се¬ред аматорів і посів шосте місце у групі «А» (+6 =2 -10 м’ячі 26:37).

У сезоні 2019/2020 років ФК «Ужгород» дебютував у другій лізі чемпіонату України. «Пер¬ший млинець виявився глевким» – передостаннє, десяте місце, у групі «А». А ось нас¬тупного се¬зону ужгородці під керівництвом Михайла Іваниці виступили напрочуд вдало – друге місце у гру¬пі та путівка до першої ліги. Дебют на новому рівні вийшов не надто вдалим і після осінньої частини сезону ФК «Ужгород» посідав передостаннє п’ятнадцяте місце. Варто зазначити, що після п’ятого туру очолив команду Богдан Бла¬ваць¬кий, який у 80-ті роки виступав у складі «Мотора» Куликів. Через початок повно¬масштабної війни футбольний сезон 2021/2022 років так і не було завершено. Перед стартом наступного сезону керівництво клубу при¬зупинило участь ко¬ман¬ди у чемпіонаті України, проте було збережено профе¬сій¬ний статус клубу.

На початку липня 2024 року відбулося об’єднання клубів ФК «Ужгород» та «СХІ» Уж¬город, який у сезоні 2023/2024 років спробував свої сили у розіграші аматорського кубку України та приймав участь у першій лізі чемпіонату України U-19. Відтак ФК «Ужгород» після дворічної паузи повернувся до виступів у змаганнях ПФЛ.

У групі «А» другої ліги команда, основу якої склали молоді вихованці закарпатського фут¬болу, виступила досить непогано і фінішувала на підсумковій шостій сходинці турнірної табли¬ці. У 18 проведених поєдинках вихованці головного тренера Яромира ЛОБОДИ здобули 26 пунктів (7 перемог, 5 нічиїх та 6 по¬разок).

Чемпіонат 2025/2026 ФК «Ужгород» розпочав з сенсаційної нічиї в Одесі та домашньої поразки від «Скали 1911». Після цього вихованці Яромира Лободи зуміли вибороти очко у грі з грізним у той період ФК «Лісне» та здобули дві перемоги над земляками із Вільхівців та у Вінниці. Далі була прикра мінімальна поразка на власному полі від ФК «Самбір-Нива-2» та невдалий виїзд у Куликів. Після цього ФК «Ужгород» здолав «Атлет» та поступився у грі з «двійкою» «Полісся» і перебував у нижній частині турнірної таблиці. Покращити свої результати ужгородцям вдалося на старті другого кола. Здобувши чотири поспіль перемоги команда піднялася на третю турнірну сходинку. Проте розвинути свій поступ та втриматися у числі лідерів закарпатським футболістам невдалося: після нічиї у «закарпатському дербі» команда зазнали п’ять поспіль поразок і на зимовий відпочинок з двадцятьма чотирма пунктами в активі пішла посідаючи восьму турнірну сходинку.

Під час зимового міжсезоння у складі команди відбулося чимало змін. Так залишили команду низка провідних виконавців: Олег Вишневський (Словаччина), Іван Вовкунович, Ерік Гречка, Роберт Смокоровський, Павло Тищук, Шелельо Микола (усі – «Крайна» Баранинці), Антоній Емере («ЮКСА» Київ), Максим Максимець («Прикарпаття-Благо» Івано-Франківськ). Натомість поповнили команду Арсен Білінський (ФК «Кудрівка» U-19), Гліб Бушняк («Епіцентр» U-19 Кам’я¬нець-Подільський), Матвій Жеребецький («ЮКСА» Київ), Ростислав Зіпір («Карпати» U-19 Львів), Сергій Ребриш (Чехія), Дмитро Рожко (ФСК «Фенікс-Маріуполь»), Максим Терещенко (Поль¬ща), Кирило Ховайко («ЮКСА» Київ).

Весняну частину чемпіонату омолоджена команда Яромира Лободи розпочала з двох поспіль гостьових перемог та домашньої нічиї з столичним «Атлетом». Завдяки цим успіхам ФК «Ужгород» піднявся на шосту турнірну сходинку з перспективами поборотися і за вищу турнірну позицію. Проте домашня поразка у «закарпатському дербі» та сенсаційна нічия на власному полі з аутсайдером з Одеси практично поклала край цим сподіванням. Відтак за чотири тури до завершення чемпіонату ужгородці й надалі шості у турнірній таблиці.
Протягом чемпіонату 2025/2025 р.р. у складі ФК «Уж¬город» вис¬тупали: Ан¬тошин Дмитро (1998) – 21/6, Бисага Максим (2008) – 14, Білінський Арсен (2008) – 2, Бушняк Гліб (2006) – 6/6п., Вашкеба Юрій (2006) – 18, Вишневський Олег (1995) – 15/4, Вовкунович Іван (2006) – 8, Волошин Євгеній (2006) – 17, Гаврилець Юрій (2007) – 4, Гречка Ерік (1998) – 1/1п., Емере Антоній (2002) – 18/4, Жеребецький Матвій (2008) – 6/1, Іванов Дмитро (2008) – 3, Ільчук Іван (2000) – 23/2, Кічун Максим (2008) – 22/1, Коваленко Дмитро (2005) – 10/3, Коцан Анд¬рій (2007) – 18/24п., Максимець Максим (2003) – 17, Минайленко Максим (1998) – 18/2, Мориляк Іван (2007) – 19/1, Муко¬ме¬ла Євген (2002) – 4, Ребриш Сергій (2006) – 6, Рожко Дмитро (2005) – 4, Савчук Олександр (2004) – 23, Сердюковський Святослав (2010) – 4, Смокоровський Ро¬берт (1993) – 17, Терещенко Максим (2005) – 6/2, Тищук Павло (1997) – 14/1, , Ховайко Кирило (2001) – 6/3, Шелельо Микола (2001) – 13/1, Шух Дмитро (2004) – 22/1.