ФК «Ужгород» було створено у 2015 році. Команда розпочала свій виступ з чемпіонату області і у перший сезон одразу ж стала йо¬го переможцем, а та¬кож володарем кубка Закарпаття. У наступному сезоні ФК «Ужгород» знову став чемпіоном та володарем кубка об¬ласті. У чемпіонаті області ужгородці на два пункти випередили «Севлюш» Виноградів і здолали цього ж супер¬ника у вирішальному кубковому матчі – 2:0. Наступного сезону ФК «Ужгород» став п’ятим у обласному чемпіонаті, а у 2018 році – здобув бронзові нагороди.
У сезоні 2018/19 років ФК «Ужгород» дебютував у чемпіонаті України се¬ред аматорів і посів шосте місце у групі «А» (+6 =2 -10 м’ячі 26:37).

У сезоні 2019/2020 років ФК «Ужгород» дебютував у другій лізі чемпіонату України. «Пер¬ший млинець виявився глевким» – передостаннє, десяте місце, у групі «А». А ось нас-тупного се¬зону ужгородці під керівництвом Михайла Іваниці виступили напрочуд вдало – друге місце у гру¬пі та путівка до першої ліги. Дебют на новому рівні вийшов не надто вдалим і після осінньої частини сезону ФК «Ужгород» посідав передостаннє п’ятнадцяте місце. Варто зазначити, що після п’ятого туру очолив команду Богдан Бла¬ваць¬кий, який у 80-ті роки виступав у складі «Мотора» Куликів. Через початок повно¬масштабної війни футбольний сезон 2021/2022 років так і не було завершено. Перед стартом наступного сезону керівництво клубу при¬зупинило участь ко¬ман¬ди у чемпіонаті України, проте було збережено профе¬сій¬ний статус клубу.

На початку липня 2024 року відбулося об’єднання клубів ФК «Ужгород» та «СХІ» Уж-город, який у сезоні 2023/2024 років спробував свої сили у розіграші аматорського кубку України та приймав участь у першій лізі чемпіонату України U-19. Відтак ФК «Ужгород» після дворічної паузи повернувся до виступів у змаганнях ПФЛ.

У групі «А» другої ліги команда, основу якої склали молоді вихованці закарпатського фут¬болу, виступила досить непогано і фінішувала на підсумковій шостій сходинці турнірної табли¬ці. У 18 проведених поєдинках вихованці головного тренера Яромира ЛОБОДИ здобули 26 пунктів (7 перемог, 5 нічиїх та 6 по¬разок). Протягом чемпіонату 2024/2025 р.р. у складі ФК «Уж¬город» вис¬тупали: Ан¬тошин Дмитро (1998) – 13, Богомаз Назарій (2000) – 12/3, Вашкеба Юрій (2006) – 3, Вишневський Олег (1995) – 6/3, Вов¬ку¬нович Іван (2006) – 2, Волошин Євгеній (2006) – 17/1, Гаврилець Юрій (2007) – 10, Емере Антоній (2002) – 16/2, Ільчук Іван (2000) – 18/4, Ка¬ра¬ман Ярослав (2006) – 3/1, Кічун Максим (2008) – 15/1, Коваленко Дмитро (2005) – 16/8, Кому¬ніцький Владислав (2004) – 2, Коцан Анд¬рій (2007) -7/7п., Лушпінь Владислав (2005) – 12, Ма¬рюхнич Іван (2004) – 2, Минайленко Максим (1998) – 15/1, Мориляк Іван (2007) – 10/1, Муко¬ме¬ла Євген (2002) – 15, Немецков Микита (2006) – 11, Пов¬хан Іван (2003) – 3, По¬по¬вич Назар (2006) – 7, Постемський Олександр (2006) – 12/18п., Савчук Олександр (2004) – 5, Смокоровський Ро¬берт (1993) – 10, Степанов Бог¬дан (2007) – 5, Цигак Василь (2006) – 12, Шаленик Володимир (2007) – 2, Шух Дмитро (2004) – 14.

По завершенні сезону 2024/25 р.р. команду покинули воротар Олександр ПОСТЕМСЬКИЙ («ЮКСА» Тарасівка), нападники Назарій БОГОМАЗ («Агробізнес» Волочиськ) та Богдан СТЕ¬ПА¬НОВ (повернувся з оренди до «Полісся» U19 Житомир). Натомість склад команди поповнили юні воротар Владислав ГЛИВКА («Зірка SPAR» Лінці Закарпатська обл.), півзахисники Максим БИСАГА («Мункач» U17 Мукачево), Святослав СЕРДЮКОВСЬКИЙ («УФК-Кривбас» U15 Дніпро), Дмитро ІВАНОВ («Шахтар» U17 Донецьк), а також більш досвідчені гравці Микола ШЕЛЕЛЬО («Зірка SPAR» Лінці), Максим МАКСИМЕЦЬ та Петро ТИЩУК (обидва – ФК «Минай).

Чемпіонат 2025/2026 ФК «Ужгород» розпочав з сенсаційної нічиї в Одесі та домашньої поразки від «Скали 1911». Після цього вихованці Яромира Лободи зуміли вибороти очко у грі з грізним у той період ФК «Лісне» та здобули дві перемоги над земляками із Вільхівців та у Вінниці. Далі була прикра мінімальна поразка на власному полі від ФК «Самбір-Нива-2» та невдалий виїзд у Куликів. Після цього ФК «Ужгород» здолав «Атлет» та поступився у грі з «двійкою» «Полісся» і перебував у нижній частині турнірної таблиці. Покращити свої результати ужгородцям вдалося на старті другого кола. Здобувши чотири поспіль перемоги команда піднялася на третю турнірну сходинку. Проте розвинути свій поступ та увійти до числа лідерів невдалося: після нічиї у «закарпатському дербі» футболісти з Ужгорода зазнали двох поспіль поразок і перед вісімнадцятим туром з двадцятьма чотирма пунктами в активі посідають п’яту турнірну сходинку.

Протягом чемпіонату 2025/2025 р.р. у складі ФК «Уж¬город» вис¬тупали: Ан¬тошин Дмитро (1998) – 12/4, Бисага Максим (2008) – 10, Вашкеба Юрій (2006) – 12, Вишневський Олег (1995) – 13/4, Вов¬ку¬нович Іван (2006) – 7, Волошин Євгеній (2006) – 14, Гречка Ерік (1998) – 1/1п., Емере Антоній (2002) – 15/4, Іванов Дмитро (2008) – 1, Ільчук Іван (2000) – 15/2, Кічун Максим (2008) – 15, Коваленко Дмитро (2005) – 4, Коцан Анд¬рій (2007) -15/17п., Максимець Максим (2003) – 14, Минайленко Максим (1998) – 11/2, Мориляк Іван (2007) – 13/1, Муко¬ме¬ла Євген (2002) – 4, Савчук Олександр (2004) – 14, Сердюковський Святослав (2010) – 2, Смокоровський Ро¬берт (1993) – 12, Тищук Павло (1997) – 12/1, Шелельо Микола (2001) – 10/1, Шух Дмитро (2004) – 13/1.

Також ФК «Ужгород» взяв участь у розіграші Кубку України 2025/2026, проте вже у грі 1/32 фіналу з рахунком 1:2 поступився на власному полі команді «Фенікс-Маріуполь» і вибув з турніру.